Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Hmgn5Q9JL35 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmgn5Q9JL35 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Hmgn5Q9JL35 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Hmgn5Q9JL35 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Hmgn5Q9JL35 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Hmgn5Q9JL35 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Hmgn5Q9JL35 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Hmgn5Q9JL35 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Hmgn5Q9JL35 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Hmgn5Q9JL35 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Hmgn5Q9JL35 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Hmgn5Q9JL35 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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Hmgn5Q9JL35 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Hmgn5Q9JL35 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgn5Q9JL35 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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