Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rb1cc1Q9ESK9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
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Rb1cc1Q9ESK9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
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