Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim54Q9ERP3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim54Q9ERP3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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