Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ndufs3Q9DCT2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ndufs3Q9DCT2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ndufs3Q9DCT2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms