Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9D454 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9D454 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9D454 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9D454 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9D454 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9D454 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9D454 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9D454 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9D454 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9D454 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9D454 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D454 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D454 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D454 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D454 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D454 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D454 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D454 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D454 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D454 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D454 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D454 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D454 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D454 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D454 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D454 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D454 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D454 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D454 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D454 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D454 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D454 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D454 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D454 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D454 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D454 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D454 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D454 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D454 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D454 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D454 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D454 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D454 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D454 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D454 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D454 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D454 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D454 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D454 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D454 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D454 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D454 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D454 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D454 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D454 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D454 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D454 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D454 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms