Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms