Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
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Trappc6bQ9D289 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Trappc6bQ9D289 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Trappc6bQ9D289 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Trappc6bQ9D289 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Trappc6bQ9D289 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Trappc6bQ9D289 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Trappc6bQ9D289 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Trappc6bQ9D289 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Trappc6bQ9D289 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6bQ9D289 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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