Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms