Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rfc5Q9D0F6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rfc5Q9D0F6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rfc5Q9D0F6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rfc5Q9D0F6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rfc5Q9D0F6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rfc5Q9D0F6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rfc5Q9D0F6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rfc5Q9D0F6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rfc5Q9D0F6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rfc5Q9D0F6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rfc5Q9D0F6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rfc5Q9D0F6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rfc5Q9D0F6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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