Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mis12Q9CY25 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms