Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PmpcbQ9CXT8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PmpcbQ9CXT8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PmpcbQ9CXT8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PmpcbQ9CXT8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PmpcbQ9CXT8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PmpcbQ9CXT8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PmpcbQ9CXT8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PmpcbQ9CXT8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PmpcbQ9CXT8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PmpcbQ9CXT8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PmpcbQ9CXT8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PmpcbQ9CXT8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PmpcbQ9CXT8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PmpcbQ9CXT8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PmpcbQ9CXT8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PmpcbQ9CXT8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PmpcbQ9CXT8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PmpcbQ9CXT8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms