Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmed5Q9CXE7 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed5Q9CXE7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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