Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CWU4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CWU4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms