Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms