Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms