Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms