Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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