Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdm1Q9CQK3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms