Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms