Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms