Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Chchd1Q9CQA6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Chchd1Q9CQA6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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