Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg3Q9CPX6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms