Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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