Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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NsmfQ99NF2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NsmfQ99NF2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 242.5 ms