Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Hdac9Q99N13 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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Hdac9Q99N13 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Hdac9Q99N13 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Hdac9Q99N13 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Hdac9Q99N13 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Hdac9Q99N13 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Hdac9Q99N13 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Hdac9Q99N13 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Hdac9Q99N13 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Hdac9Q99N13 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Hdac9Q99N13 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Hdac9Q99N13 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Hdac9Q99N13 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Hdac9Q99N13 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac9Q99N13 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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