Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms