Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Sh3bp5lQ99LH9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Sh3bp5lQ99LH9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Sh3bp5lQ99LH9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Sh3bp5lQ99LH9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Sh3bp5lQ99LH9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Sh3bp5lQ99LH9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Sh3bp5lQ99LH9 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms