Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms