Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

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Length 429 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxp3Q99JB6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxp3Q99JB6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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