Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ddb2Q99J79 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ddb2Q99J79 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ddb2Q99J79 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ddb2Q99J79 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ddb2Q99J79 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ddb2Q99J79 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ddb2Q99J79 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms