Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ctu1Q99J10 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ctu1Q99J10 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ctu1Q99J10 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ctu1Q99J10 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ctu1Q99J10 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ctu1Q99J10 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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