Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Pde6cQ91ZQ1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Pde6cQ91ZQ1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
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Pde6cQ91ZQ1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Pde6cQ91ZQ1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Pde6cQ91ZQ1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Pde6cQ91ZQ1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pde6cQ91ZQ1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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