Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd3Q91W18 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms