Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smg8Q8VE18 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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