Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4Q8VCH8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms