Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms