Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Vmn1r200Q8R281 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms