Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Rnf183Q8QZS5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Rnf183Q8QZS5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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