Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Vmn1r188Q8K3N2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Vmn1r188Q8K3N2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Vmn1r188Q8K3N2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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Vmn1r188Q8K3N2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Vmn1r188Q8K3N2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Vmn1r188Q8K3N2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Vmn1r188Q8K3N2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Vmn1r188Q8K3N2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Vmn1r188Q8K3N2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Vmn1r188Q8K3N2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Vmn1r188Q8K3N2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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