Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
OptnQ8K3K8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms