Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms