Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Mtmr3Q8K296 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Mtmr3Q8K296 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Mtmr3Q8K296 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Mtmr3Q8K296 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Mtmr3Q8K296 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Mtmr3Q8K296 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Mtmr3Q8K296 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Mtmr3Q8K296 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr3Q8K296 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms