Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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