Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sde2Q8K1J5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms