Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdc34Q8CFI2 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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