Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx8Q8CFD4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx8Q8CFD4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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