Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm9955Q8CEJ8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm9955Q8CEJ8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm9955Q8CEJ8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm9955Q8CEJ8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm9955Q8CEJ8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm9955Q8CEJ8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm9955Q8CEJ8 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Gm9955Q8CEJ8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
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Gm9955Q8CEJ8 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
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Gm9955Q8CEJ8 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
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Gm9955Q8CEJ8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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Gm9955Q8CEJ8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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Gm9955Q8CEJ8 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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Gm9955Q8CEJ8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm9955Q8CEJ8 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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