Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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