Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf31Q8CCF0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf31Q8CCF0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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