Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Atg4aQ8C9S8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Atg4aQ8C9S8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
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Atg4aQ8C9S8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
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Atg4aQ8C9S8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Atg4aQ8C9S8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Atg4aQ8C9S8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Atg4aQ8C9S8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Atg4aQ8C9S8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Atg4aQ8C9S8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Atg4aQ8C9S8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Atg4aQ8C9S8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Atg4aQ8C9S8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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Atg4aQ8C9S8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Atg4aQ8C9S8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Atg4aQ8C9S8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Atg4aQ8C9S8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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